İçeriğe geç
OptikOptik.
DUS · Temel Bilimler

Yapısal Biyokimya Soru Çözümü

Yapısal Biyokimya, DUS Temel Bilimler hazırlığında karşına çıkan konulardan biri. Aşağıda bu konudan seçilmiş çözümlü örnek sorular ve adım adım açıklamalar var. Tamamını çözdükten sonra Optik uygulamasında bu konudan daha fazla soruyu yapay zekâ destekli çözümlerle çalışabilirsin.

Soru 1

Bir enzimin substrat konsantrasyonuna karşı reaksiyon hızının Lineweaver-Burk grafiği çizildiğinde, inhibitörsüz durumda eğim 2.0 (birim: min) ve y-kesimi 0.1 (birim: 1/(μM/min)) olarak bulunmuştur. Aynı enzime kompetitif bir inhibitör eklendiğinde, grafiğin eğimi 4.0 olarak ölçülmüştür. İnhibitörlü durumda enzimin $K_m$ değeri nasıl değişir?

  1. A

    $K_m$ değişmez.

  2. B

    $K_m$ yarıya iner.

  3. $K_m$ iki katına çıkar.

    Doğru cevap
  4. D

    $K_m$ dört katına çıkar.

  5. E

    $K_m$ dörtte birine iner.

Çözüm

Lineweaver-Burk grafiğinde, eğim $K_m / V_{max}$ ve y-kesimi $1/V_{max}$ değerine eşittir. Kompetitif inhibisyonda $V_{max}$ değişmez, so y-kesimi aynı kalır. İnhibitörsüz eğim 2.0, inhibitörlü eğim 4.0 olduğuna göre, eğim iki katına çıkmıştır. Since $V_{max}$ sabit, $K_m$ da iki katına çıkar. Therefore, $K_m$ doubles.

Soru 2

Histidin titrasyon eğrisinde, pH 3 ile 8 arasındaki tamponlama bölgesi hangi iyonize edilebilir grubun davranışını yansıtır?

  1. İmidazol yan zinciri

    Doğru cevap
  2. B

    Karboksil grubu

  3. C

    Amino grubu

  4. D

    Hem karboksil hem amino grubu

  5. E

    Hiçbiri

Çözüm

Tamponlama bölgesi, bir grubun pKa değeri etrafında, pH değişimine karşı direnç gösterdiği bölgedir. Histidin için imidazol grubunun pKa2 değeri 6.0'dır, bu nedenle pH 3-8 aralığı (özellikle pKa ± 1-2 birim) bu grubun iyonizasyonunu temsil eder. Karboksil grubu pKa1=1.8 ve amino grubu pKa3=9.2 olduğundan, bu aralıkta baskın değillerdir.

Soru 3

Aşağıdaki enzimlerden hangisi, katalizlediği reaksiyon tipi bakımından diğerlerinden farklıdır? (Not: Enzim sınıflarını düşünün.)

  1. A

    Alkol dehidrojenaz (alkol + $NAD^+$ → aldehit + $NADH$ + $H^+$)

  2. B

    Glukoz-6-fosfat izomeraz (glukoz-6-fosfat ↔ fruktoz-6-fosfat)

  3. C

    Sitrat sentaz (oksaloasetat + asetil-CoA → sitrat + CoA-SH)

  4. Pirüvat karboksilaz (pirüvat + $CO_2$ + ATP → oksaloasetat + ADP + Pi)

    Doğru cevap
  5. E

    Alanin transaminaz (alanin + α-ketoglutarat → pirüvat + glutamat)

Çözüm

Ligazlar, ATP veya benzeri nükleotid trifosfat kullanarak iki molekülü birleştiren (bağ oluşturan) reaksiyonları katalizler. Pirüvat karboksilaz, $CO_2$ fiksasyonu için ATP kullanan bir ligazdır. Diğer enzimler: alkol dehidrojenaz (oksidoredüktaz), glukoz-6-fosfat izomeraz (izomeraz), sitrat sentaz (transferaz, asetil grubu transferi), alanin transaminaz (transferaz, amino grubu transferi). Bu nedenle, sadece D şıkkı ligaz sınıfına girer.

Yapısal Biyokimya konusunu uygulamada çöz

Optik'te DUS Temel Bilimler dersinde yapısal biyokimya konusundan daha fazla soru, anlık AI çözümleri ve konu tekrarı seni bekliyor.